菌肥，亦称生物肥、生物肥料、细菌肥料或接种剂等。
菌肥，形象说来就是“菌+肥”，因为菌肥一方面含有“有机质、氮、磷、钾”等作物生长所必需的营养成分，同时产品中还含有大量的有益微生物菌，有益微生物菌在土壤中繁殖，起到改良土壤、防治病害等功能。
菌肥是近年来经常见到的肥料之一，在农业生产中经常见到，在我国菌肥近年来发展较快。
菌肥是微生物肥料的俗称，它是一种带活菌体的辅助性肥料。
土壤中存在着大量的微生物（包括细菌、真菌、放线菌），一般每克土含有几亿至几十亿个微生物。
有些对作物生长发育有益，有些则有害。
人们用科学的方法从土壤中分离、选育有益微生物，经过培养、繁殖、制成菌剂，将这些菌剂应用于农业，使作物增产，称为菌肥，又叫做微生物肥料。
目前我国生产和应用的菌肥主要有根瘤菌、固氮菌、磷细菌、钾细菌、抗生菌肥料等。
菌肥是通过有益微生物的生命活动，拮抗有害微生物，促进土壤中养分的转化，提高土壤养分的有效性，改善作物营养条件，增加土壤肥力。
微生物肥料的主要功效是促进植物根系的发育。只要我们能知道植物根系的重要性，就能知道生物有机肥内含的多种功能性微生物进入土壤后，在生长繁殖过程中产生大量的次生代谢产物，这些产物能够促进土壤团粒结构的形成。团粒结构的形成能使土壤变得疏松、绵软，保水保肥性能增强，水、气、热更加协调，减少土壤板结，有利于保水、保肥、通气和促进根系发展，为农作物提供舒适的生长环境。
菌肥包括（复合微生物肥料，生物有机肥，微生物菌剂）它即含有部分氮磷钾大量元素和部分有机质，主要是添加了微生物活性菌种，从生产成本上必定是高于有机肥的。
什么是菌肥？菌肥都有哪些？
1、枯草芽孢杆菌：增加作物抗逆性、固氮。
2、巨大芽孢杆菌：解磷（磷细菌），具有很好的降解土壤中有机磷的功效。
3、胶冻样芽孢杆菌：解钾，释放出可溶磷钾元素及钙、硫、镁、铁、锌、钼、锰等中微量元素。
4、地衣芽孢杆菌：抗病、杀灭有害菌。
5、苏云金芽孢杆菌：杀虫（包括根结线虫），对鳞翅目等节肢动物有特异性的毒杀活性。
6、侧孢芽孢杆菌：促根、杀菌及降解重金属，
7、胶质芽孢杆菌：有溶磷、释钾和固氮功能，分泌多种酶，增强作物对一些病害的抵抗力。
8、泾阳链霉菌：具有增强土壤肥力、刺激作物生长的能力。
9、菌根真菌：扩大根系吸收面，增加对原根毛吸收范围外的元素（特别是磷）的吸收能力。
10、棕色固氮菌：固定空气中的游离氮，增产。
11、光合菌群：是肥沃土壤和促进动植物生长的主力部队。
12、凝结芽孢杆菌：可降低环境中的氨气、硫化氢等有害气体。提高果实中氨基酸的含量。
13、米曲霉：使秸秆中的有机质成为植物生长所需的营养，提高土壤有机质，改善土壤结构。
14、淡紫拟青霉：对多种线虫都有防治效能，是防治根结线虫有前途的生防制剂。
菌肥的重要作用
三种以上多种复合菌相互促进、相互补充，抗土传病害效果远远大于单一菌种。有益菌群相互协同，共同作用，能使作物达到高产丰产的效果。
（1）促进快速生长：能产生刺激作物生长的生物激素。菌肥中的微生物在土壤内的生命活动过程中，会产生大量的赤霉素和细胞激素类等物质，这些物质在与植物根系接触后，能调节作物的新陈代谢，刺激作物的生长，从而使作物产生增产效果。
（2）调节生命活动，增产增收：菌群中的胶冻样芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等有益菌可促进作物根系生长，须根增多。有益微生物菌群代谢产生的植物内源酶和植物生长调节剂经由根系进入植物体内，促进叶片光合作用，调节营养元素往果实流动，膨果增产效果明显。与施用化肥相比，在等价投入的情况下可增产15%-30%。
（3）果实品质明显提高：菌群中的侧孢芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、凝结芽孢杆菌等可降低植物体内硝酸盐含量20%以上，能降低重金属含量，可使果实中Vc含量提高30%以上，可溶性糖提高2-4度。乳酸菌、嗜酸乳杆菌、凝结芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等可提高果实中必需氨基酸（赖氨酸和蛋氨酸）、维生素B族和不饱和脂肪酸等的含量。果实口感好，耐储藏，卖价高。
（4）分解有机物质和毒素，防止重茬：菌群中的米曲菌、地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物能加速有机物质的分解，为作物制造养分、提供动力，能分解连作有毒有害物质，防止重茬。
（5）根际环境保护屏障：菌群中的地衣芽孢杆菌等有益微生物施入土壤后，迅速繁殖成为优势菌群，控制根际营养和资源，使重茬、根腐、立枯、流胶、灰霉等病原菌丧失生存空间和条件。使植物根系细胞的细胞壁增厚，纤维化、木质化，并生成角质双硅层，形成阻止病原菌侵袭的坚固屏障。
（6）增强抗逆性：菌肥中的微生物在植物根部大量生长、繁殖，从而形成优势菌群，优势菌群形成局部优势，这样就能抑制和减少病原菌的入侵和繁殖机会，起到了减轻作物病害的功效。菌群中的地衣芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌等有益微生物可增强土壤缓冲能力，保水保湿，增强作物抗旱、抗寒、抗涝能力；同时侧孢芽孢杆菌还可强化叶片保护膜，抵抗病原菌侵染，抗病，抗虫。
生物肥值钱的就是里面所含有的活性菌，菌的活性重要。
当然考虑到微生物菌肥主要成分为生物活性菌，在使用过程中禁止大家以下操作。
1、不能与杀菌剂混合使用，防治根腐病、根癌等土传病害；（见杀菌剂就死亡）
2、紫外线可以杀灭微生物菌肥里面的生物活性菌；（见紫外线就死亡）
3、与化肥混用要注意化肥用量不能过大。高浓度的化学物质对菌肥里的微生物有毒害作用。
4、注意温度过高，过低，干旱条件下的作物田块不建议施用生物菌肥。会影响菌肥活性。
5、注意不要冲施生物菌肥，因为水会冲散菌群，影响菌肥效果。
6、注意：菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。通常把有机质称为生物菌的载体。也就是说有机质是生物菌赖以生存的食物。所以一定记得补充土壤有机质确保菌肥功效！
菌肥生产中载体很重要，关乎菌的活性能力。
话说回来，土壤中有足够的有机物或腐殖质时微生物才能更好的生存繁殖起作用，激活其他营养元素。
微生物菌在土壤中作用主要是产生各种酶，分解各种养分，产生各种酸和二氧化碳，给作物提供更多养分。而微生物菌要成活和繁殖，土壤中要有足够的有机质才行。所以我们提倡有机肥和和菌肥搭配使用！
土壤有机质含量足，土壤理化性状就好，加强了土壤有益微生物的活动，从而大限度促使有机物分解转化，产生多种营养物质和刺激性物质，反过来又刺激微生物的生长发育，促进作物生长，达到增产增收的目的。
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